酒曲由于其分类依据多样化、复杂化，导致酒曲分类错综复杂、相互交叉。酒曲微生物是发酵产酒的主要原因，不同酒曲能生产不同酒类，根据酒曲来分类可以把白酒分为大曲酒、小曲酒、红曲酒、麦曲酒、麸曲酒。

      

     按制酒曲原料来分主要有小麦和稻米。故分别称为麦曲和米曲用稻米制的曲，种类也很多，如用米粉制成的小曲，用蒸熟的米饭制成的红曲或乌衣红曲，米曲（米曲霉）。

     1、大曲：用于蒸馏酒的酿造。这种类型主要由大麦、小麦和豌豆经过改良加工制造而成的酒曲。许多名酒（蒸馏酒）都用大曲酿酒，因为酿出来的酒质量相对于酒曲好很多。

     2、小曲：主要用于黄酒和小曲白酒的酿造。小曲是米糠或者米粉，再加点中草药炼制而成，有一股淡淡的香气。用小曲酿酒，转化率较高。

     3、红曲：主要用于红曲酒的酿造（红曲酒是黄酒的一个品种）。

     4、麦曲：主要用于黄酒的酿造。主要成分是稻米和小麦制成的。

     5、麸曲：发展到现代，酿曲工艺提升了不少。人们开始用麸皮为原料，利用霉菌接种技术进行麸曲培养。
 
     不同的环境下，采取不同发霉的原料，制成的酒曲也有所不同。所以才有多种类别的酒曲诞生。